学校设有基础医学院、临床医学院、药学院、针灸推拿学院、第二临床医学院、护理学院、公共卫生与管理学院、人文社科学院、医学技术学院、体育学院、外语学院、民族医药学院、国际教育学院、成人教育学院、峨眉学院15个学院。
成都中医药大学(原名成都中医学院)创建于1956年, 1995年经国家教委批准更为现名, 2006年6月四川生殖卫生学院、四川省卫生管理干部学院并入成都中医药大学。
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